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2007 — Single-Cell-Based Models in Biology and Medicine (Anderson, Chaplain, Rejniak)

Book info

  • Title: Single-Cell-Based Models in Biology and Medicine
  • Editors: Alexander R.A. Anderson, Mark A.J. Chaplain, Katarzyna A. Rejniak
  • Year: 2007
  • Publisher: Birkhäuser (Basel · Boston · Berlin)
  • Series: Mathematics and Biosciences in Interaction
  • ISBN: 978-3-7643-8101-1
  • DOI: 10.1007/978-3-7643-8123-3

Reading notes

Chapter Title One-line summary
00 总论 13 种单细胞建模方法的全景导览。
01 HDC 肿瘤侵袭 Anderson 的混合离散-连续技术,从 PDE 推导个体行为概率。
02 LGCA 发育细胞 Deutsch 的格子气细胞自动机 + Boltzmann 稳定性分析。
03 2D 多尺度趋化 Alber 严格推导 CPM → Fokker-Planck → Keller-Segel 的微观-宏观桥接。
04 GGH 模型简史 Glazier 等追溯从 Ising 模型到 Glazier-Graner-Hogeweg 模型的演化。
05 CPM 生物物理 Marée 等把 CPM 参数映射到具体可测量的生物物理量。
06 CPM 生物医学 表皮干细胞、肿瘤、血管生成的 CPM 应用三大案例。
07 GGH 扩展 离格扩展、ECM 力学、GPU 并行、CompuCell3D 平台。
08 中心基模型 Drasdo 把细胞视为"胶体粒子"——JKR + 中心基 + 三种 Metropolis 算法。
09 中心基 + 连续场 Dallon 的 PIC 方法——D. discoideum 聚集 + 伤口愈合应用。
10 亚细胞元模型 Newman 用元素云构造自适应细胞形状。
11 血液凝固 IB Fogelson 把浸没边界法应用于血小板聚集。
12 3D 椭球细胞 Palsson 的椭球 + Kelvin-Voigt + 力平衡模型。
13 复杂组织 IB Rejniak 把 IB + 源汇推广到组织发育(滋养层、克隆肿瘤、腺泡)。

Book-level summary

  • book_summary.md — 11-section 全书概括,含术语表、跨章关联、总体评价。

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